Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm20518E9Q548 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms