Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Pgbd1E9Q492 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms