Protein–RNA interactions for Protein: E9Q411

Nbas, Neuroblastoma-amplified sequence, mousemouse

Predictions only

Length 2,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NbasE9Q411 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NbasE9Q411 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms