Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Vmn1r238E9Q373 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Vmn1r238E9Q373 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms