Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
2610021A01RikE9Q0Q3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms