Protein–RNA interactions for Protein: E9Q007

Gm4450, Predicted gene 4450, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4450E9Q007 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm4450E9Q007 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gm4450E9Q007 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms