Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Ddx60E9PZQ1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Ddx60E9PZQ1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
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Ddx60E9PZQ1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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Ddx60E9PZQ1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ddx60E9PZQ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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