Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ryr1E9PZQ0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ryr1E9PZQ0 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms