Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gm5415E9PXF3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gm5415E9PXF3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms