Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Abca16E9PWJ7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Abca16E9PWJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms