Protein–RNA interactions for Protein: E9PW80

Gm3298, Predicted gene 3298, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3298E9PW80 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Gm3298E9PW80 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3298E9PW80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3298E9PW80 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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