Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim30bE9PVL6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim30bE9PVL6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms