Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc17E9PVB5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc17E9PVB5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms