Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Piezo1E2JF22 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Piezo1E2JF22 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms