Protein–RNA interactions for Protein: D3Z623

9330159F19Rik, MCG7194, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9330159F19RikD3Z623 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
9330159F19RikD3Z623 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
9330159F19RikD3Z623 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms