Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430403G16RikD3Z5L4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430403G16RikD3Z5L4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms