Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim12cD3Z3L3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim12cD3Z3L3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms