Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ptprz1B9EKR1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms