Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms