Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Trappc11B2RXC1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms