Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Cspp1B2RX88 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms