Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cped1B2RX70 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cped1B2RX70 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms