Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AU015836B2RUM3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AU015836B2RUM3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms