Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Apba1B2RUJ5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Apba1B2RUJ5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms