Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc22a28B2RT89 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms