Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf3B2RQG2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf3B2RQG2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms