Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Usp42B2RQC2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Usp42B2RQC2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms