Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Uhrf1bp1B2KF50 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Uhrf1bp1B2KF50 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms