Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Brpf3B2KF05 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms