Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
H60cB1B213 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
H60cB1B213 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms