Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik3B1AS29 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik3B1AS29 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms