Protein–RNA interactions for Protein: B1ARI9

Prr29, Proline-rich protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr29B1ARI9 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prr29B1ARI9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prr29B1ARI9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms