Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm11127A7VMS2 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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