Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Odf2A3KGV1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms