Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc9bA3KGF9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms