Protein–RNA interactions for Protein: A2TJV2

Palm3, Paralemmin-3, mousemouse

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palm3A2TJV2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Palm3A2TJV2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Palm3A2TJV2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms