Protein–RNA interactions for Protein: A2RSJ4

Uhrf1bp1l, UHRF1-binding protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uhrf1bp1lA2RSJ4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms