Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tubb1A2AQ07 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms