Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CtcflA2APF3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CtcflA2APF3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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