Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lcn6A2AJB9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lcn6A2AJB9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Lcn6A2AJB9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lcn6A2AJB9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms