Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prdm12A2AJ77 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prdm12A2AJ77 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms