Protein–RNA interactions for Protein: A2AIW0

Sdccag3, Serologically defined colon cancer antigen 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag3A2AIW0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sdccag3A2AIW0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sdccag3A2AIW0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms