Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
4930447F04RikA2AFR2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms