Protein–RNA interactions for Protein: A2AED3

Fndc7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc7A2AED3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fndc7A2AED3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fndc7A2AED3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms