Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb4A2A863 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb4A2A863 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms