Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Calcoco2A2A6M5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Calcoco2A2A6M5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms