Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Sppl2cA2A6C4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Sppl2cA2A6C4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms