Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

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Length 959 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Akap17bA2A3V1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Akap17bA2A3V1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Akap17bA2A3V1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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