Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fam71e1A1L3C1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Tbata-210ENSMUST00000151886 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71e1A1L3C1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms