Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms